主债务已经过了诉讼时效的，抵押权并没有消灭，但是由于主债务过了诉讼时效，抵押权不再受人民保护。只有抵押人自愿承担其担保义务的，抵押权人才能行使该抵押权。所以抵押权人应当在主债务的诉讼时效内行使抵押权。
【法律依据】
《民法典》第四百一十九条
抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民不予保护。
第四百一十四条
同一财产向两个以上债权人抵押的，拍卖、变卖抵押财产所得的价款依照下列规定清偿：
（一）抵押权已经登记的，按照登记的时间先后确定清偿顺序；
（二）抵押权已经登记的先于未登记的受偿；
（三）抵押权未登记的，按照债权比例清偿。
其他可以登记的担保物权，清偿顺序参照适用前款规定。
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